nefrНефрологияNephrology (Saint-Petersburg)1561-62742541-9439Pavlov First Saint-Petersburg State Medical Universitynefr-205Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ КЛИНИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL ARTICLES CLINICAL STUDIESЕсть ли дневные вариации микробиоты мочи у здоровых женщин?Does the urine microbiota of healthy women vary during daytime?НабокаЮ. Л.NabokaYu. L.nagu22@mail.ruКоганМ. И.KoganM. I.dept_kogan@mail.ruГудимаИ. А.GudimaI. A.nagu22@mail.ruЗаруцкийС. А.ZarutskiyS. A.aks1.rostov@gmail.comДжалагонияК. Т.JalagoniaK. T.nagu22@mail.ruРостовский государственный медицинский университетРоссияRostov State Medical UniversityRussian Federation2016010920162053642Copyright © Набока Ю.Л., Коган М.И., Гудима И.А., Заруцкий С.А., Джалагония К.Т., 20162016Набока Ю.Л., Коган М.И., Гудима И.А., Заруцкий С.А., Джалагония К.Т.Naboka Y.L., Kogan M.I., Gudima I.A., Zarutskiy S.A., Jalagonia K.T.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.nephrolog.ru/jour/article/view/205

ЦЕЛЬ: исследование микробиоты мочи у здоровых женщин в дневное время суток. ПАЦИЕНТЫ И МЕТОДЫ. Проведено бактериологическое исследование мочи у 20 здоровых сексуально активных женщин в различное время суток (8:00, 12:00, 16:00). Исследование мочи проводили на расширенном наборе питательных сред для факультативно-анаэробных и неклостридиально-анаэробных бактерий. Использованы 10 питательных сред. Для создания анаэробных условий использовали HiAnaerobic System - Mark VI или AnaeroHiGas Pak. Расчеты выполняли в среде статистической обработки и визуализации данных R. РЕЗУЛЬТАТЫ. При бактериологическом исследовании 60 образцов мочи стерильные посевы отсутствовали. В группе факультативно-анаэробных бактерий в течение дня с высокой частотой (>60,0%) обнаруживали коагулазоотрицательные стафилококки и Corynebacterium spp. В группе неклостридиально- анаэробных бактерий стабильными ассоциантами являлись Eubacterium spp., Peptococcus spp., Propionibacterium spp., Lactobacillus spp. Уровень бактериурии для всех верифицированных в моче у здоровых женщин микроорганизмов в подавляющем большинстве случаев был <103 КОЕ/мл. Значимые различия по частоте обнаружения различных родов бактерий в моче в течение дня отсутствовали. Значимых различий в уровнях бактериурии не выявлено за исключением 3 родов. Дендрограммы свидетельствуют о высоком уровне подобия частоты присутствия и концентрации микроорганизмов в различные сроки. ЗАКЛЮЧЕНИЕ. У здоровых женщин характерный спектр мочи идентифицируется независимо от времени дня.

THE AIM: to study the urine microbiota of healthy women during daytime. PATIENTS AND METHODS. We performed bacteriological examination of urine samples from 20 healthy sexually active women taken at different time (at 8:00, 12:00, and 16:00). Examination of the urine was performed using an extended set of culture media for facultative anaerobic and non-clostridial anaerobic bacteria. 10 culture media were used. HiAnaerobic System - Mark VI or AnaeroHiGas Pak were used to create anaerobic conditions. Calculations were performed in R software environment for statistical computing and graphics. RESULTS. Bacteriological examination of 60 urine specimens revealed no sterile samples. In the facultative anaerobic bacteria group, coagulase-negative staphylococci and Corynebacterium spp. were detected with high frequency (>60,0%) throughout the day. In the nonclostridial anaerobic bacteria group, Eubacterium spp., Peptococcus spp., Propionibacterium spp., and Lactobacillus spp. demonstrated stable association. Bacteriuria level for all microorganisms verified in the urine of healthy women in the overwhelming majority of cases was <103 CFU/ml. Cochran’s test established the absence of significant variations in the detection frequency of different bacterial genera during the day. Except for 3 genera, no significant differences in the bacteriuria levels were revealed. Dendrograms indicate high level of similarity between the presence frequency and concentration of microorganisms at different points in time. CONCLUSION. Typical spectrum of the urine is identified in healthy women irrespectively of the time of the day.

мочаздоровые женщиныаэробные и анаэробные бактерииurinehealthy womenaerobic and anaerobic bacteriaReferencesВоробьев АА. Медицинская микробиология, вирусология и иммунология. МИА, М., 2004; 690Воробьев АА. Медицинская микробиология, вирусология и иммунология. МИА, М., 2004; 690Osborne NG. Acute urinary-tract infection: a condition over-diagnosed in women? J of Gynecologic Surgery 2008;24(1):51-54Osborne NG. Acute urinary-tract infection: a condition over-diagnosed in women? J of Gynecologic Surgery 2008;24(1):51-54Коган МИ, Набока ЮЛ, Гудима ИА и др. Микробный спектр мочи молодых здоровых женщин. Урология 2010;5:7-10Коган МИ, Набока ЮЛ, Гудима ИА и др. Микробный спектр мочи молодых здоровых женщин. Урология 2010;5:7-10Naboca JL, Kogan MI, Gudima IA et al. Harnflora bei gesunden frauen. ArchivEuroMedica 2011;1-2:155-157Naboca JL, Kogan MI, Gudima IA et al. Harnflora bei gesunden frauen. ArchivEuroMedica 2011;1-2:155-157Siddiqui H, Nederbragt AJ, Lagesen K et al. Assesing diversity of the female urine microbiota by high throughput sequencing of 16S RNA amplicons. BMC Microbiol 2011;11:244-251Siddiqui H, Nederbragt AJ, Lagesen K et al. Assesing diversity of the female urine microbiota by high throughput sequencing of 16S RNA amplicons. BMC Microbiol 2011;11:244-251Fouts DE, Pieper R, Szpakowski S et al. Integrated next-generation sequencing of 16S rDNA and metaproteomics differentiate the healthy urine microbiome from asymptomatic bacteriuria in neuropathic bladder associated with spinal cord injury. J TranslFouts DE, Pieper R, Szpakowski S et al. Integrated next-generation sequencing of 16S rDNA and metaproteomics differentiate the healthy urine microbiome from asymptomatic bacteriuria in neuropathic bladder associated with spinal cord injury. J TranslWolfe AJ, Toh E, Shibata N et al. Evidence of uncultivated bacteria in the adult female bladder. J Clin Microbiol 2012; 50(4):1376-1383Wolfe AJ, Toh E, Shibata N et al. Evidence of uncultivated bacteria in the adult female bladder. J Clin Microbiol 2012; 50(4):1376-1383Клинические рекомендации. Европейская ассоциация урологов. 2015 [Klinicheskie rekomendatsii. Evropeyskaya assotsiatsiya urologov. 2015]Клинические рекомендации. Европейская ассоциация урологов. 2015 [Klinicheskie rekomendatsii. Evropeyskaya assotsiatsiya urologov. 2015]Методические указания МУ 4.2.2039-05. Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории, М., 2006; 43-59Методические указания МУ 4.2.2039-05. Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории, М., 2006; 43-59Wolfe AJ, Brubaker L. «Sterile urine» and the presence of bacteria. Eur Urol 2015;68:173-174Wolfe AJ, Brubaker L. «Sterile urine» and the presence of bacteria. Eur Urol 2015;68:173-174Hilt EE, McKinley K, Pearce MM et al. Urine is not sterile: use of enhanced urine culture techniques to detect resident bacterial flora in the adult female bladder. J Clin Microbiol 2014;52(3):871-876Hilt EE, McKinley K, Pearce MM et al. Urine is not sterile: use of enhanced urine culture techniques to detect resident bacterial flora in the adult female bladder. J Clin Microbiol 2014;52(3):871-876Pearce MM, Hilt EE, Rosenfeld AB et al. The female urinary microbiome: a comparison of women with and without urgency urinary incontinence. Mbio 2014;5(4):є01283-14Pearce MM, Hilt EE, Rosenfeld AB et al. The female urinary microbiome: a comparison of women with and without urgency urinary incontinence. Mbio 2014;5(4):є01283-14

The authors declare that there are no conflicts of interest present.